More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3457 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  56.71 
 
 		 581 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  56.71 
 
 		 581 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  57.91 
 
 		 610 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  57.64 
 
 		 582 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  86.54 
 
 		 629 aa  1040    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  62.45 
 
 		 573 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  58.6 
 
 		 573 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 694 aa  1395    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  59.01 
 
 		 583 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  58.66 
 
 		 611 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  56.04 
 
 		 582 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  62.36 
 
 		 582 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  62.36 
 
 		 582 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  62.36 
 
 		 582 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  55.46 
 
 		 580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  54.68 
 
 		 592 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  52.79 
 
 		 585 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  51.41 
 
 		 602 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  53.71 
 
 		 586 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  54.43 
 
 		 602 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  45.39 
 
 		 663 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  49.72 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  50.29 
 
 		 531 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  43.84 
 
 		 678 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  43.86 
 
 		 664 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  42.65 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  48.69 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  43.71 
 
 		 600 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  52.41 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  44.79 
 
 		 577 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  45.41 
 
 		 639 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  41.67 
 
 		 662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  45.27 
 
 		 651 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  42.61 
 
 		 573 aa  392  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  38.36 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  40.93 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  39.58 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.41 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  40.89 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  40.34 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  44.37 
 
 		 606 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  38.07 
 
 		 546 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  39.96 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  39.96 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  38.31 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  39.81 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  38.31 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  40.12 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  40.99 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  39.48 
 
 		 523 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  37.36 
 
 		 516 aa  364  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  37.67 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  37.24 
 
 		 532 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.68 
 
 		 506 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  37.78 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  39.76 
 
 		 580 aa  359  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  37.59 
 
 		 516 aa  359  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  37.59 
 
 		 516 aa  359  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.05 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  37.22 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  40.27 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  38.11 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  37.41 
 
 		 516 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  37.41 
 
 		 516 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  40.81 
 
 		 497 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  36.7 
 
 		 516 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  35.95 
 
 		 530 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.36 
 
 		 516 aa  353  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 		 567 aa  353  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  38.81 
 
 		 530 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  40.84 
 
 		 659 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  40.84 
 
 		 659 aa  352  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  44.72 
 
 		 593 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  36.93 
 
 		 551 aa  350  6e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  40.43 
 
 		 558 aa  350  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  39.3 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  41.22 
 
 		 541 aa  346  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  38.77 
 
 		 526 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  36.62 
 
 		 609 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  40.46 
 
 		 606 aa  344  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  38.46 
 
 		 538 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.22 
 
 		 667 aa  343  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  40.73 
 
 		 526 aa  343  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  39.22 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  38.12 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  37.15 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  37.01 
 
 		 538 aa  339  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  38.5 
 
 		 545 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  41.08 
 
 		 673 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  38.95 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  38.63 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  40.12 
 
 		 676 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  39.31 
 
 		 535 aa  336  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  39.39 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  39.61 
 
 		 676 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>