More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4708 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  60.56 
 
 		 536 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 552 aa  1075    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  65.15 
 
 		 542 aa  689    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  52.16 
 
 		 552 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  49.91 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  49.64 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  49.82 
 
 		 565 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  37.75 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  39.36 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  39.43 
 
 		 505 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  39.63 
 
 		 505 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  39.63 
 
 		 505 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  39.43 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  39.43 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  39.43 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  39.6 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  38.82 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  41.3 
 
 		 531 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  37.57 
 
 		 505 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  38.62 
 
 		 504 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  40.16 
 
 		 504 aa  323  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  39.88 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  38.41 
 
 		 504 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.98 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  35.24 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  36.14 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  35.24 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  35.57 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  36.48 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  36.05 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  38.17 
 
 		 508 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  34.41 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  40.2 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  37.16 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  36.81 
 
 		 659 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.73 
 
 		 657 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  36.61 
 
 		 659 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  36.93 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  37.6 
 
 		 661 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  34.48 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  35.73 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  35.4 
 
 		 661 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  36.51 
 
 		 494 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  35.71 
 
 		 516 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  37.4 
 
 		 573 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  41.23 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  33.21 
 
 		 546 aa  297  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 516 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 516 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  37.65 
 
 		 661 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.53 
 
 		 551 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  35.61 
 
 		 526 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 516 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  34.87 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  37.55 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  36.19 
 
 		 685 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  37.06 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  39.68 
 
 		 497 aa  292  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  38.27 
 
 		 545 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  36.86 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  36.86 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  34.81 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  34.72 
 
 		 542 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  34.9 
 
 		 580 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  34.17 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  34.81 
 
 		 660 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  34.83 
 
 		 682 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  36.48 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  37.94 
 
 		 611 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  33.97 
 
 		 660 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  34.85 
 
 		 644 aa  288  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  36.29 
 
 		 668 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  33.58 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  35.81 
 
 		 583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  35.32 
 
 		 538 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  35.34 
 
 		 530 aa  287  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  34.18 
 
 		 646 aa  287  4e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  35.55 
 
 		 664 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.9 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  37.26 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  36.24 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.4 
 
 		 567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  35.32 
 
 		 661 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  32.53 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.9 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  32.66 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  36.96 
 
 		 687 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  32.66 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  35.8 
 
 		 658 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  35.1 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 606 aa  282  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.6 
 
 		 637 aa  282  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  36.8 
 
 		 602 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  36.11 
 
 		 673 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  36.61 
 
 		 682 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  35.46 
 
 		 658 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  35.46 
 
 		 658 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>