More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0190 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  100 
 
 		 525 aa  1058    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0820  BCCT transporter  36.12 
 
 		 516 aa  336  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1254  transporter, BCCT family  32.73 
 
 		 507 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  32.74 
 
 		 503 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  34.12 
 
 		 583 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  34.25 
 
 		 573 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  32.23 
 
 		 497 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  32.71 
 
 		 523 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0927  BCCT transporter  34.31 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  33 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  33.66 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  32.34 
 
 		 490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  35.02 
 
 		 582 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  35.02 
 
 		 582 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  35.21 
 
 		 582 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.74 
 
 		 494 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.47 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.47 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  34.59 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  31.95 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.47 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 573 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  31.99 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.25 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.66 
 
 		 551 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  33.47 
 
 		 661 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  33.2 
 
 		 611 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  31.03 
 
 		 603 aa  259  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  32.58 
 
 		 584 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.99 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.07 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  31.03 
 
 		 505 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  30.08 
 
 		 531 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 585 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  33.05 
 
 		 661 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4319  choline/carnitine/betaine transporter  32.34 
 
 		 534 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32.09 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.81 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.02 
 
 		 657 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  30.98 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  33.99 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  30.72 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  29.88 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  31.72 
 
 		 667 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  31.44 
 
 		 556 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  30.6 
 
 		 583 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  30.59 
 
 		 656 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  30.02 
 
 		 659 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  31.72 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  29.37 
 
 		 659 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  30.5 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  28.66 
 
 		 577 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  31.14 
 
 		 580 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  32.24 
 
 		 667 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  29.75 
 
 		 698 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  31.37 
 
 		 679 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  32.24 
 
 		 667 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.78 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  32.24 
 
 		 667 aa  247  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  31.14 
 
 		 514 aa  247  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5112  choline/carnitine/betaine transporter  31.53 
 
 		 667 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  30.67 
 
 		 545 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  33.64 
 
 		 660 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  29.52 
 
 		 526 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.64 
 
 		 606 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  30.69 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  32.62 
 
 		 582 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  32.03 
 
 		 667 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  29.65 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  29.17 
 
 		 568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 		 574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  31.53 
 
 		 667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  32.15 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3107  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  30.18 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  30.18 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  32.53 
 
 		 592 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  31.88 
 
 		 664 aa  243  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  30.84 
 
 		 534 aa  243  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  32.07 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  29.96 
 
 		 667 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  29.91 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>