More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4319 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4319  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 534 aa  1059    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  44.31 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  45.05 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  44.35 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  39.85 
 
 		 606 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  42.33 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  42.49 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  42.04 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  42.02 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  39.8 
 
 		 600 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  38.58 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  40.93 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  40.73 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  40.52 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  39.07 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  39.45 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  40.52 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  39.88 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  39.07 
 
 		 659 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  40.44 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  40.52 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.52 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  39.48 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  38.21 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  41.7 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  37.11 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  39.24 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  37.88 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  39.03 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  37.87 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  36.43 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  36.91 
 
 		 592 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  37.12 
 
 		 573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  37.77 
 
 		 531 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  38.59 
 
 		 538 aa  360  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  37.45 
 
 		 582 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.85 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  37.18 
 
 		 610 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  37.45 
 
 		 582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  37.45 
 
 		 582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  36.24 
 
 		 582 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  39.1 
 
 		 538 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  38.38 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  36.55 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  39.77 
 
 		 583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  37.24 
 
 		 578 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  37.28 
 
 		 657 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  37.34 
 
 		 573 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  37.1 
 
 		 661 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  34.63 
 
 		 629 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  35.83 
 
 		 584 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  38.59 
 
 		 646 aa  348  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  39.08 
 
 		 606 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  37.63 
 
 		 682 aa  348  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  35.46 
 
 		 582 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  40.97 
 
 		 524 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  35.46 
 
 		 581 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  37.47 
 
 		 637 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  35.46 
 
 		 581 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  37.05 
 
 		 531 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  37.18 
 
 		 661 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  36.87 
 
 		 552 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 656 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  36.86 
 
 		 611 aa  343  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  35.44 
 
 		 694 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 		 567 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  35.55 
 
 		 534 aa  340  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  37.47 
 
 		 609 aa  339  8e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  37.27 
 
 		 660 aa  339  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.43 
 
 		 567 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  39.48 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  36.69 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  38.63 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  37.79 
 
 		 685 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  38.63 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  38.55 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  38.63 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  36.71 
 
 		 530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  38.31 
 
 		 644 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  38.43 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  38.43 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  38.43 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  38.43 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  36.56 
 
 		 574 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  38.43 
 
 		 516 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  36.82 
 
 		 606 aa  334  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  36.27 
 
 		 660 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  37.81 
 
 		 602 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  37.1 
 
 		 668 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  37.63 
 
 		 673 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  37.92 
 
 		 658 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  37.92 
 
 		 658 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  37.72 
 
 		 658 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>