More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2888 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  88.28 
 
 		 529 aa  907    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  100 
 
 		 555 aa  1104    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  73.49 
 
 		 518 aa  697    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  48.76 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  50.86 
 
 		 519 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  47.74 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  49.69 
 
 		 554 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  48.63 
 
 		 524 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  47.99 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  46.75 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  50.77 
 
 		 534 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  48.99 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  45.9 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  49.22 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  46.37 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  46.37 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  46.37 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  46.37 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  46.37 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  46.17 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  46.17 
 
 		 522 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  46.37 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  47.15 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  49.61 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  46.95 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  42.45 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  42.26 
 
 		 516 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  41.95 
 
 		 537 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  40.81 
 
 		 516 aa  336  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  41.75 
 
 		 518 aa  319  9e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  34.64 
 
 		 519 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  47.58 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  32.16 
 
 		 671 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  29.22 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  31.75 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  28.35 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  30.29 
 
 		 678 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  31.66 
 
 		 666 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  30.23 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  30.75 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  32.57 
 
 		 698 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  29.94 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  30.11 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  32.69 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4827  BCCT transporter  31.12 
 
 		 664 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.767861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5269  choline transporter  31.33 
 
 		 664 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  32.67 
 
 		 686 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30 
 
 		 551 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  30.45 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.35 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  29.2 
 
 		 506 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  33.6 
 
 		 531 aa  223  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  30.56 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  30.68 
 
 		 659 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  29.78 
 
 		 663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  31.57 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 		 673 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  28.6 
 
 		 644 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0244  choline/carnitine/betaine transporter  31.74 
 
 		 667 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300044  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  32.78 
 
 		 676 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  31.2 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  30.54 
 
 		 661 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0253  choline/carnitine/betaine transporter  31.55 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.984352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  32.56 
 
 		 676 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  27.98 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  29.18 
 
 		 573 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4983  choline/carnitine/betaine transporter  31.53 
 
 		 665 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.684113  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0229  choline/carnitine/betaine transporter  31.56 
 
 		 653 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  29.98 
 
 		 606 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  31.48 
 
 		 676 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  32.45 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.33 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  29.52 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  30.81 
 
 		 573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  31.12 
 
 		 582 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  31.12 
 
 		 582 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  29.96 
 
 		 681 aa  213  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  31.01 
 
 		 503 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  32.36 
 
 		 676 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  32.75 
 
 		 667 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  32.36 
 
 		 676 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  29.77 
 
 		 661 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  30.92 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  30.61 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  31.85 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  30.5 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  29.81 
 
 		 526 aa  211  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  29.45 
 
 		 497 aa  211  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  29.92 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  30.16 
 
 		 580 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  29.92 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  33.48 
 
 		 572 aa  210  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03056  hypothetical protein  30.37 
 
 		 632 aa  210  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  31.03 
 
 		 684 aa  210  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  30.06 
 
 		 665 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>