219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1408 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  85.52 
 
 
298 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  85.52 
 
 
298 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.91 
 
 
298 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  85.57 
 
 
298 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  82.55 
 
 
298 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  83.89 
 
 
298 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  84.18 
 
 
298 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.45 
 
 
258 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  66.78 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  66.78 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  65.44 
 
 
298 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  57.38 
 
 
299 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  55.12 
 
 
301 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  54.79 
 
 
301 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  56.72 
 
 
297 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  50.5 
 
 
303 aa  271  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  57.36 
 
 
272 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  56.23 
 
 
272 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  55.81 
 
 
303 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  52.94 
 
 
272 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  45.96 
 
 
276 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  57.38 
 
 
203 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  44.15 
 
 
272 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  57.95 
 
 
204 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  53.59 
 
 
211 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  56.67 
 
 
201 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  47.37 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  51.93 
 
 
205 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  51.1 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  44.44 
 
 
232 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  46.59 
 
 
208 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  46.89 
 
 
208 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.33 
 
 
207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  42.35 
 
 
205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  44.63 
 
 
200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  45.81 
 
 
209 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  39.11 
 
 
206 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  39.11 
 
 
206 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
266 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  38.89 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  42.78 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  35.2 
 
 
225 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  36.07 
 
 
208 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  36.07 
 
 
208 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  40.91 
 
 
208 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  41.67 
 
 
211 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  41.67 
 
 
211 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  35.12 
 
 
210 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  37.1 
 
 
216 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  61.36 
 
 
106 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  38.99 
 
 
211 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  35.29 
 
 
216 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  40.13 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  40.24 
 
 
228 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  36.9 
 
 
245 aa  96.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.31 
 
 
208 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  33.5 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  33.14 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.7 
 
 
205 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  27.53 
 
 
209 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  35.48 
 
 
213 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  34.09 
 
 
222 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  36.17 
 
 
213 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  35.29 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.28 
 
 
206 aa  89.7  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  33.95 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  36.14 
 
 
216 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  31.16 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.24 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  35.19 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  28.33 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  32.93 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  34.69 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  35.37 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.14 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  31.29 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  30.56 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.54 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  31.9 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  33.12 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  27.59 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  31.15 
 
 
207 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
801 aa  62.4  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  31.52 
 
 
799 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  31.03 
 
 
201 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  27.88 
 
 
199 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
939 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
791 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  27.71 
 
 
198 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  32.2 
 
 
800 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  32.2 
 
 
800 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.11 
 
 
726 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>