256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3334 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 
272 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  90.81 
 
 
272 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  67.91 
 
 
272 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  58.87 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  58.21 
 
 
298 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  56.98 
 
 
298 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  56.98 
 
 
298 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  54.91 
 
 
298 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  54.91 
 
 
298 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.36 
 
 
298 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.98 
 
 
298 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  54.91 
 
 
298 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  55.97 
 
 
297 aa  278  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  55.85 
 
 
299 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  60.66 
 
 
303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  51.89 
 
 
301 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  51.14 
 
 
301 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.12 
 
 
258 aa  248  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  52.04 
 
 
303 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  43.59 
 
 
276 aa  227  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  61.36 
 
 
201 aa  205  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  60.77 
 
 
204 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  38.43 
 
 
272 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  57.06 
 
 
203 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  52.49 
 
 
211 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  52.54 
 
 
209 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  57.3 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  51.41 
 
 
232 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  45.05 
 
 
269 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  51.69 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  44.74 
 
 
207 aa  148  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  45.2 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  48.3 
 
 
200 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  49.44 
 
 
208 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  42.94 
 
 
206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  42.94 
 
 
206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  42.13 
 
 
208 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  42.13 
 
 
208 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  46.89 
 
 
209 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  40.11 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  42.93 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  39.64 
 
 
205 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  38.86 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  44.38 
 
 
207 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  39.01 
 
 
208 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  30.51 
 
 
209 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  39.04 
 
 
210 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  41.48 
 
 
208 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.13 
 
 
218 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  40.96 
 
 
214 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  41.99 
 
 
211 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  41.99 
 
 
211 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  38.38 
 
 
204 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  37.14 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  40 
 
 
216 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  39.67 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.75 
 
 
211 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  42.05 
 
 
228 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.58 
 
 
205 aa  93.2  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  33.52 
 
 
206 aa  92.8  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  38.29 
 
 
212 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  38.86 
 
 
245 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  34.55 
 
 
213 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  40.34 
 
 
216 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  34.92 
 
 
222 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  39.43 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  38.14 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.29 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  39.47 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  35.45 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  37.5 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.59 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  32.95 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  34.73 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  34.38 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  32.74 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  29.26 
 
 
314 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
800 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  33.74 
 
 
201 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 
305 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
800 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  25.41 
 
 
331 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  34.46 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
799 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
799 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
783 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  34.48 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
335 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
783 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>