113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1521 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  58.82 
 
 		 212 aa  228  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  58.82 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  55.45 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  52.74 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  52.26 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  60.22 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  49.03 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  50.24 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  48.76 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  51.26 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  55.28 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  50.75 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  46.53 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  42.57 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  42.57 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  40.1 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  40.1 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  41.94 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  50.79 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 266 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  45.45 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  41.49 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  42.29 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  44 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  42.05 
 
 		 283 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  37.81 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  31 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  34.98 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  37.37 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  34.67 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  33.17 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  34.8 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  34.17 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  30.39 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  29.27 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  35.87 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  27.36 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  37.14 
 
 		 303 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  34.32 
 
 		 298 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  35.33 
 
 		 299 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.27 
 
 		 298 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.27 
 
 		 298 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  38.29 
 
 		 272 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.94 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.13 
 
 		 298 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.33 
 
 		 298 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.33 
 
 		 298 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  37.71 
 
 		 272 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.33 
 
 		 258 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  33.93 
 
 		 298 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  33.93 
 
 		 298 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  31.16 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.93 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  34.52 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  33.85 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  35.12 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  28.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  30.68 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  32.83 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.98 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  30.68 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  30.89 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  30.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  30.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  30.54 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.21 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  25.93 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  30.18 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  32.82 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  34.72 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  32.64 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  28.65 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  27.43 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.96 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  32.77 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  34.12 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  28.42 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  33.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  29.1 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  27.27 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  32.77 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  32.07 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.23 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 312 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 317 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 365 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  26.96 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  32.39 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  27.22 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>