218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2332 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  53.77 
 
 
216 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  58.79 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  50.74 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  46.89 
 
 
213 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  50.96 
 
 
222 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  49.47 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  49.24 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  50.97 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  50.27 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  54.4 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  51.55 
 
 
283 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  48.94 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  46.63 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  47.37 
 
 
216 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  42.58 
 
 
216 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  46.8 
 
 
214 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  42.03 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  41.15 
 
 
225 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  41 
 
 
208 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  41 
 
 
208 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  46.77 
 
 
213 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  48.48 
 
 
236 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  39.05 
 
 
266 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  45.18 
 
 
219 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  42.57 
 
 
204 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  37.11 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  34.17 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  36.55 
 
 
232 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  33.49 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  51.59 
 
 
207 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  36.6 
 
 
203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  36.14 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  32.23 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  38.18 
 
 
299 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  33.84 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  36.79 
 
 
201 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  37.8 
 
 
298 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  38.31 
 
 
301 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 
298 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.93 
 
 
258 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  37.66 
 
 
301 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.15 
 
 
298 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  38.99 
 
 
298 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  35.43 
 
 
303 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.67 
 
 
298 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.67 
 
 
298 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.66 
 
 
298 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  36.08 
 
 
298 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  36.08 
 
 
298 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  39.43 
 
 
272 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  33.16 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  33.16 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  35.8 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  37.58 
 
 
303 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  34.52 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  34.27 
 
 
276 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 
298 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  36.46 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  33.53 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  30.88 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  32.83 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  36.81 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  32.16 
 
 
208 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  37.28 
 
 
272 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  33.7 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  28.34 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  29.53 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  30.26 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  30.85 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  36.94 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  31.47 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  30.85 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  29.89 
 
 
203 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  29.74 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  30.46 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  30.46 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.33 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.08 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  31.52 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
314 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  32.24 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  31.58 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  30.05 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  34.05 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  29.83 
 
 
329 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  28.11 
 
 
303 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  29.95 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.95 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.95 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
317 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  29.52 
 
 
298 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>