125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2151 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  69.19 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  64.59 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  57.69 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  56.04 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  58.13 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  56.44 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  56.31 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  63.46 
 
 		 213 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  65.05 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  51.46 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  59.04 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  56.37 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  49.03 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  52.72 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  48.94 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  51.01 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  41.79 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  41.79 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  45.02 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  40.3 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  44.15 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  42.63 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  44.12 
 
 		 283 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  43.5 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  36.55 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  40.09 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  43.56 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  32.51 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  35.68 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  35.26 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  39.58 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  37.69 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  34.52 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  32.31 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.22 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.22 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  30.57 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  41.81 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  36.63 
 
 		 298 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.51 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  41.14 
 
 		 272 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.9 
 
 		 298 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  35.96 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.71 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  35.71 
 
 		 298 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  35.71 
 
 		 298 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  41.48 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  36.31 
 
 		 298 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  37.57 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  34.95 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  34.95 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  39.2 
 
 		 272 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  36.7 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  31.32 
 
 		 276 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  32.76 
 
 		 297 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  32.77 
 
 		 299 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  33.14 
 
 		 301 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  35.67 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  34.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  35.9 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  29.9 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  31.91 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  32.34 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  41.32 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.22 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  32.77 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  31.22 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  31.58 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  35.35 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.63 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  36.51 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  29.65 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  28.65 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  31.15 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  33.54 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  32.37 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  34.18 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  30 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  35.98 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  31.15 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  31.15 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  35.45 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  26.51 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  32.02 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  24.02 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  24.02 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 315 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>