141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2056 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  100 
 
 		 212 aa  410  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  54.12 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  53.93 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  55.5 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  55.08 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  54.4 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  51.01 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  57.37 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  53.72 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  49.48 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  50 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  55.83 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  50.84 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  49.21 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  50.28 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  49.72 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  35.03 
 
 		 283 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  38.71 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  55.29 
 
 		 108 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  29.51 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  23.66 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  35.07 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.68 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  30.9 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.68 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  31.94 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  26.4 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  31.63 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.78 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  28.33 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  27.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.62 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  31.66 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.01 
 
 		 298 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.01 
 
 		 298 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  33.53 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  31.22 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  29.74 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  34.15 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  24.49 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.89 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  24.71 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  29.63 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  28.57 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  31.75 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  26.84 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  30.73 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  29.34 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  33.96 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  31.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  29.79 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  30.11 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  29.85 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  29.63 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  26.19 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  32.93 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  31.33 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  30.35 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  28.9 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  28.49 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  28.14 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  28.14 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  31.82 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  28.81 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  28.81 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  29.17 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  32.11 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  29.41 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  28.83 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  27.94 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  26.47 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  26.8 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  24.04 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  24.04 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  33.68 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  25.9 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 328 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  30.84 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  29.52 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  26.05 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  27.78 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  28.64 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 309 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  28.06 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 		 319 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>