258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1855 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  68.37 
 
 		 205 aa  278  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  64.56 
 
 		 211 aa  271  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  60 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  57.44 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  54.59 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  52.17 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  58.43 
 
 		 299 aa  207  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  55.31 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  49.5 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  55.87 
 
 		 301 aa  204  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  56.11 
 
 		 297 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  49.72 
 
 		 298 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  49.72 
 
 		 298 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  50.55 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  49.72 
 
 		 298 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  49.72 
 
 		 298 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  51.1 
 
 		 298 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.63 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  49.16 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 258 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.28 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.15 
 
 		 298 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  56.52 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  52.3 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.83 
 
 		 298 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  53.45 
 
 		 272 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  45.56 
 
 		 272 aa  165  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  47.06 
 
 		 276 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  46.7 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  44.33 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  50.57 
 
 		 303 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  38.92 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 		 266 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  35.58 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  43.39 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  35.1 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  35.1 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  37.3 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  33.17 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  35.64 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  35.64 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  33.49 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  38.14 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  31.68 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  39.2 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  38.3 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  38.3 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  33.17 
 
 		 283 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  32.83 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  31.75 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  33.67 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  32.31 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  32.68 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  33.82 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  30.89 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  31.07 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  33.67 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.5 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  33.33 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  31.58 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  29.27 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  29.59 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  31.94 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  27.27 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  30.05 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  33.66 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  32.98 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  29.47 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  29.29 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  28.14 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  26.4 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  25.79 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  26.47 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  30.57 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.53 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  25.93 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  26.2 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  25.39 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  25.77 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  28.07 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  24.64 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  23.12 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  25.13 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  26.34 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.13 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.36 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.36 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.36 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.7 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>