282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3474 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  89.93 
 
 		 298 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  89.93 
 
 		 298 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.9 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.56 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  86.53 
 
 		 298 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  87.88 
 
 		 298 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  84.18 
 
 		 298 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  89.26 
 
 		 258 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  70.37 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  70.37 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  68.69 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  57.72 
 
 		 299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  55 
 
 		 301 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  54.33 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  53.69 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  58.11 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  55.56 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  58.11 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  50.67 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  52.94 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  46.32 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  45.66 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  59.66 
 
 		 203 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  59.78 
 
 		 201 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  60.8 
 
 		 204 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  48.5 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  51.38 
 
 		 211 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  53.04 
 
 		 205 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  50.55 
 
 		 209 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  43.92 
 
 		 232 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  48.86 
 
 		 208 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  47.78 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  48.59 
 
 		 200 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  46.33 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  40.7 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  40.7 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  47.74 
 
 		 209 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  39.64 
 
 		 205 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  36.9 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  37.43 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  37.43 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.32 
 
 		 106 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  38.89 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  43.6 
 
 		 207 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  37.63 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  40 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  37.8 
 
 		 211 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  45.45 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  45.45 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  29.94 
 
 		 209 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  33.85 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  36.93 
 
 		 216 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.63 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  38.95 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  41.28 
 
 		 228 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  33.75 
 
 		 205 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35.23 
 
 		 222 aa  99.4  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  35.47 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  32.8 
 
 		 212 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  36.76 
 
 		 213 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.59 
 
 		 213 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.79 
 
 		 245 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  33.14 
 
 		 218 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  37.97 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.32 
 
 		 204 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  33.74 
 
 		 213 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  37.35 
 
 		 216 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  33.33 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  35.06 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  34.5 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  29.51 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  37.25 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  32.37 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  27.27 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  33.52 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  34.39 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  31.11 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  29.35 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  33.53 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  31.41 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  30.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  28.49 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  32.35 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  29.12 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  24.34 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  26.74 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.32 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.32 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.32 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>