237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2560 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  81.9 
 
 		 245 aa  307  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  58.12 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  61.86 
 
 		 283 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  55.5 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  46.8 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  45.02 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  49.03 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  43.46 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  45.73 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  45.19 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  52.15 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  44 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  42.08 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  47.62 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  43.9 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  41.09 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  46.5 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  39.02 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  42.21 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  37.98 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  43.3 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  50.82 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  33.82 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  37.04 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  37.82 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  39.09 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  47.21 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  39.09 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  31.28 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  36.14 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  43.46 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  35.35 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  33.84 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  36.92 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  38.46 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  31.71 
 
 		 276 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  39.5 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  37.97 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  39.38 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.05 
 
 		 298 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.05 
 
 		 298 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  41.71 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  35.29 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  41.71 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.71 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  41.14 
 
 		 272 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.31 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.71 
 
 		 298 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.08 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.85 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  35.44 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  35.44 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  38.97 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  38.22 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  39.46 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  32.99 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  33 
 
 		 297 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  32.99 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  33.33 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  38.92 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  38.51 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  40.45 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  35.08 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  37.89 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  35.38 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  37.23 
 
 		 199 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  36.13 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  30.53 
 
 		 272 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  35.38 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  39.77 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  37.3 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  40.99 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  38.61 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  35.38 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  38.71 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  37.84 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  32.2 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  32.99 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  29.23 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  30.22 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  31.44 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  30.73 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  30.73 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  33.51 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  33.51 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  27.7 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.32 
 
 		 299 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>