113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3643 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  100 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  95.19 
 
 		 205 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  93.58 
 
 		 205 aa  297  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  84.62 
 
 		 201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  63.27 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  66.84 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  65.61 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  62.77 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  61.14 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  61.46 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  61.22 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  56.77 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  64.4 
 
 		 196 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  58.64 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  51.72 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  43.33 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  66.67 
 
 		 108 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  36.36 
 
 		 283 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  38.5 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  38.89 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.98 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  33.33 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.98 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37 
 
 		 245 aa  87.8  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  35.79 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.87 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  34.59 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  33.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 		 266 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  35.2 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  29.44 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  32.78 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  32.78 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  32.54 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  34.05 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  31.35 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  26.34 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  32.37 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.67 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.48 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  31.06 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  27.09 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  32.65 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.18 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  31.29 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.18 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.44 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  34.85 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.57 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  34.1 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  29.94 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  29.94 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.33 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  31.16 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  35.39 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.94 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  30.53 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  37.29 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  30.93 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  31.9 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  31.9 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  28.43 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  38.55 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  27.22 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  32.57 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  31.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  35.59 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  32.28 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  29.12 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  33.15 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  29.67 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  27.17 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  25.95 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  30.41 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  31.14 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  28.41 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  32.83 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  35.45 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  26.87 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  33.14 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  32.26 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  29.9 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 626 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 305 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  29.94 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>