249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2575 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  55.33 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  55.33 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  61.98 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  42.02 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  40.21 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  40.45 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  40.53 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  44.39 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  44.39 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  43.09 
 
 		 272 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  36.36 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  33.67 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  37.5 
 
 		 301 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  38.86 
 
 		 303 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.46 
 
 		 298 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.46 
 
 		 298 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  37.5 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  44.68 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.67 
 
 		 298 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  40.86 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  36.93 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  36.02 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  33.85 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  40.91 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 298 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  40 
 
 		 298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 258 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  33.69 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  38.89 
 
 		 298 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  38.89 
 
 		 298 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  34.57 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.78 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  33.85 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  39.43 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  38.86 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  34.38 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  34.38 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.12 
 
 		 298 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  33.15 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  36.26 
 
 		 299 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.03 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  39.01 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  34.07 
 
 		 272 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.7 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  34.92 
 
 		 303 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  32.16 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  35.23 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  31.49 
 
 		 276 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  32.46 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  35.2 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  32.97 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  33.67 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  30.16 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  34.98 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  31.05 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  35.23 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  33.66 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  36.5 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.98 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  35.29 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  30.98 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  30.53 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  37.02 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  33.7 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.54 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  33.17 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  35.71 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  32.09 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  31.35 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  22.51 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  26.63 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  26.63 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.53 
 
 		 313 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.81 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  29.24 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  29.83 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  26.26 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  25.76 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>