241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0471 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  96.64 
 
 
298 aa  578  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  95.29 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.3 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  95.29 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  94.97 
 
 
298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  86.53 
 
 
298 aa  517  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  82.55 
 
 
298 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  91.36 
 
 
258 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  67.56 
 
 
298 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  67.56 
 
 
298 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  65.89 
 
 
298 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  55.7 
 
 
299 aa  331  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  52.48 
 
 
301 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  51.82 
 
 
301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  50.34 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  56.6 
 
 
272 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  56.6 
 
 
272 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  49.33 
 
 
303 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  52.33 
 
 
303 aa  251  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  50.92 
 
 
272 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  45.22 
 
 
276 aa  234  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  44.57 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  56.74 
 
 
203 aa  211  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  48.12 
 
 
269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  56.76 
 
 
204 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  51.89 
 
 
211 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  56.67 
 
 
201 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  52.25 
 
 
205 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  49.16 
 
 
209 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  44.13 
 
 
232 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  44.57 
 
 
208 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  45.3 
 
 
208 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 
106 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  42.17 
 
 
205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.33 
 
 
207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  45.16 
 
 
209 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  44.75 
 
 
200 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  38.55 
 
 
206 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  38.55 
 
 
206 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
266 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  35.45 
 
 
208 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  35.45 
 
 
208 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  34.39 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  40.33 
 
 
207 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  38.92 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  39.38 
 
 
211 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  39.38 
 
 
211 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  32.98 
 
 
283 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.31 
 
 
210 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  38.17 
 
 
216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  37.78 
 
 
208 aa  99  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.9 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  28.09 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  35.76 
 
 
216 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.08 
 
 
211 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35.23 
 
 
222 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  36.36 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  33.12 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  39.05 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  33.14 
 
 
218 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  34.07 
 
 
213 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.19 
 
 
213 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.71 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  36.84 
 
 
245 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.5 
 
 
206 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  34.05 
 
 
213 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  35.54 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  33.93 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.07 
 
 
219 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  27.62 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  34.13 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.33 
 
 
198 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  32.78 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  36.73 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  32.65 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.45 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  32.48 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  33.12 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  31.29 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  28.31 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  28.75 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  28.83 
 
 
199 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
939 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  27.65 
 
 
201 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.71 
 
 
726 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  28.31 
 
 
198 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  32.39 
 
 
205 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  32.92 
 
 
205 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
739 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.38 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
848 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
866 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>