220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1156 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  89.29 
 
 
206 aa  343  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  64.36 
 
 
283 aa  242  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  58.12 
 
 
214 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  56.02 
 
 
245 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  50.27 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  46.6 
 
 
216 aa  151  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  44.15 
 
 
208 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  44.06 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  41.88 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  40.1 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  38.07 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  41.49 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  43.98 
 
 
213 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  44.88 
 
 
228 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  40.21 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  40.32 
 
 
222 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  38 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  38.42 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  41.88 
 
 
236 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  38.55 
 
 
232 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  36.13 
 
 
207 aa  121  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  33 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  31.75 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  32.98 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  33.14 
 
 
203 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  39.3 
 
 
213 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  32.14 
 
 
204 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  30.69 
 
 
209 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.47 
 
 
298 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.47 
 
 
298 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  33.51 
 
 
208 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  32.98 
 
 
205 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  33.51 
 
 
208 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  42.47 
 
 
207 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  33.75 
 
 
298 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  38.66 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.71 
 
 
298 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  32.7 
 
 
298 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
298 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  30.15 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  31.87 
 
 
298 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  31.87 
 
 
298 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.87 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.5 
 
 
298 aa  92  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.12 
 
 
298 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  34.21 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  33.51 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.12 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  34.39 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  30.3 
 
 
276 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  32.95 
 
 
303 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  33.16 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  29.81 
 
 
299 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  32.57 
 
 
272 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  32.8 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  34.2 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  32.8 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  33.15 
 
 
272 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  32.57 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  31.25 
 
 
301 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  32.4 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  30.46 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  29.8 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  31.25 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.43 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  30.77 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  32.98 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  31.11 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  32.1 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  36.21 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  28.71 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  33.52 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  35.16 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  28.19 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  34.62 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  31.01 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  33.33 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.73 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  31.65 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.67 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  25.74 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 
306 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 
298 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  30.52 
 
 
312 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 
342 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.52 
 
 
312 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  30.52 
 
 
312 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.52 
 
 
312 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 
299 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
319 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
319 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>