107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2073 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  80 
 
 
203 aa  313  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  68.21 
 
 
198 aa  260  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  65.28 
 
 
199 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  66.13 
 
 
199 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  64.48 
 
 
201 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  65.45 
 
 
194 aa  220  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  60.73 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  61.54 
 
 
198 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  61.75 
 
 
206 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  61.82 
 
 
201 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  57.43 
 
 
196 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  62.84 
 
 
205 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  61.75 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  50.29 
 
 
212 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  44.75 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  61.05 
 
 
108 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  35.59 
 
 
283 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  32.2 
 
 
208 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  34.24 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  34.18 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  35.38 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  35 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  33.77 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  33.77 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  32.62 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  32.9 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  30.54 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  30.53 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  29.08 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35.06 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  29.61 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  30.35 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  29.67 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  25.59 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  31.15 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  33.14 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  29.76 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  29.61 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.99 
 
 
298 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.99 
 
 
298 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  25.86 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  26.67 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  27.27 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  28.5 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  27.27 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  30.82 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  33.54 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  36.96 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.72 
 
 
298 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.38 
 
 
298 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  31.41 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  30.9 
 
 
298 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  30.9 
 
 
298 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  33.09 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  33.09 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  27.36 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.17 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.41 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  31.98 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  30 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.46 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  26.49 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  25.75 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  31.46 
 
 
303 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  24.64 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  31.22 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  26.14 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  27.17 
 
 
272 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  34.48 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  32.95 
 
 
272 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  36.18 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  26.67 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  32.35 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  27.5 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  28.57 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  29.59 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  30.67 
 
 
272 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  31.34 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  30.07 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  29.65 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  27.75 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  28.29 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  28.29 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  26 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  27.62 
 
 
314 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  35.4 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0554  hypothetical protein  30.43 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.47 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.47 
 
 
393 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  29.13 
 
 
303 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>