189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0094 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  65.31 
 
 		 201 aa  255  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  62.5 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  56.78 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  57.44 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  60.87 
 
 		 299 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  60.34 
 
 		 298 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  60.34 
 
 		 298 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  57.22 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  59.66 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  58.99 
 
 		 298 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  58.99 
 
 		 298 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.43 
 
 		 298 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.87 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.87 
 
 		 298 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 		 298 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.74 
 
 		 298 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  57.38 
 
 		 298 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  62.11 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  58.76 
 
 		 301 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  54.82 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  57.39 
 
 		 297 aa  201  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  59.54 
 
 		 301 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  52.58 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  58.05 
 
 		 272 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  55.68 
 
 		 272 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  57.47 
 
 		 272 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  58.52 
 
 		 303 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  54.12 
 
 		 303 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.04 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  47.21 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  43.07 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  45.83 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  42.86 
 
 		 276 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  38.22 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  38.81 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  38.81 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  36.76 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  36.76 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  42.35 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 266 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.95 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  38.27 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  41.67 
 
 		 269 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  38.66 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  39.34 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.6 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  39.59 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  35.26 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  38.46 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  34.36 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  40 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  40 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  33.66 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  32.47 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  33.14 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  35.23 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  33.17 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  36.02 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  38.74 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.94 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.14 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  36.76 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.51 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.29 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  33.16 
 
 		 283 aa  95.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  36.81 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  35.2 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  34 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  38.55 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  29.67 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  27.64 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  26.71 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  29.38 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  28.33 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  28.31 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  28.57 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  31.82 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  29.01 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  26.42 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  28.49 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  29.94 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  27.04 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  29.38 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.42 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 		 297 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  27.92 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  25.77 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>