228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2326 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  99.66 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  98.99 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  98.99 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  97.65 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  94.97 
 
 		 298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  89.56 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  85.57 
 
 		 298 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  97.53 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  70.23 
 
 		 298 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  70.23 
 
 		 298 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  68.9 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  57.05 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  53.47 
 
 		 301 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  53.14 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  52.35 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  56.23 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  56.23 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  54.12 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  49.33 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  51.46 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  45.22 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  44.15 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  57.87 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  57.3 
 
 		 204 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  58.33 
 
 		 201 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  51.35 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  53.37 
 
 		 205 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  46.99 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  50.28 
 
 		 209 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  44.13 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  48.07 
 
 		 208 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  45.95 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 106 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  42.17 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.2 
 
 		 207 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  48.39 
 
 		 209 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  38.8 
 
 		 206 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  38.8 
 
 		 206 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  45.3 
 
 		 200 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  43.65 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  34.36 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  35.38 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  35.38 
 
 		 208 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  41.97 
 
 		 211 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  41.97 
 
 		 211 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  38.32 
 
 		 208 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  40 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  31.83 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.36 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.31 
 
 		 210 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  29.78 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  40.24 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.3 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  36.36 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  36.56 
 
 		 216 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.31 
 
 		 208 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35 
 
 		 222 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  31.87 
 
 		 205 aa  93.6  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  35.15 
 
 		 212 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  35.68 
 
 		 213 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  32.74 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.5 
 
 		 206 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  36.75 
 
 		 216 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.43 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  33.7 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.08 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  32.78 
 
 		 213 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  33.53 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  27.62 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  33.33 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.14 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  35.37 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  27.71 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  30.36 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  28.65 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  31.29 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  32.48 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  30.34 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  28.48 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 		 939 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.71 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  25.44 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  29.24 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 866 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 848 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  33.03 
 
 		 801 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>