193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2983 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  73.21 
 
 
212 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  66.01 
 
 
210 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  63.41 
 
 
213 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  58.08 
 
 
213 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  58.22 
 
 
219 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  56.04 
 
 
208 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  57.94 
 
 
216 aa  217  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  55.45 
 
 
204 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  60.09 
 
 
213 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  54 
 
 
216 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  55.56 
 
 
236 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  53.05 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  50.96 
 
 
211 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  50.48 
 
 
216 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  55.94 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  43.75 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  42.23 
 
 
208 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  42.23 
 
 
208 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  51.74 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  44.78 
 
 
283 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 
266 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  42.08 
 
 
218 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  45.19 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  40.41 
 
 
206 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  40.32 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  44.06 
 
 
245 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  33.17 
 
 
207 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  38.27 
 
 
203 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  36.73 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.18 
 
 
298 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.18 
 
 
298 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  33.33 
 
 
205 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  31.94 
 
 
232 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  35.79 
 
 
201 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  31.58 
 
 
209 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.13 
 
 
298 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  35.23 
 
 
298 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  35.53 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.23 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  31.31 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  32.95 
 
 
298 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  32.95 
 
 
298 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  34.86 
 
 
303 aa  92.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  34.09 
 
 
298 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  39.64 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  34.02 
 
 
206 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  34.02 
 
 
206 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  32.97 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  32.26 
 
 
299 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  36.59 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  37.28 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  36.93 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  34.54 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  36.36 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  36.16 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  33.51 
 
 
301 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  32.62 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  31.69 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  35.9 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  35.75 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  33.33 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  32.99 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  30.06 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  35.19 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  31.58 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  35.06 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  36.21 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  37.18 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  34.15 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  28.93 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  23.96 
 
 
316 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  23.96 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  36.71 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  27.89 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 
295 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 
302 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  36.21 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.96 
 
 
300 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 
300 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  29.85 
 
 
304 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 
316 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 
340 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  35.63 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 
398 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  31.02 
 
 
378 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>