274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0229 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  97.34 
 
 		 301 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  60.8 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  55 
 
 		 298 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  55.12 
 
 		 298 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  53.47 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  53.47 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.8 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.47 
 
 		 298 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.48 
 
 		 298 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.81 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  55.22 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  55.22 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  54.24 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  52.04 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  55.22 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  58.65 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  50.36 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  51.52 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  51.52 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  50.57 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  62.22 
 
 		 205 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  43.75 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  40.66 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  59.77 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  55.87 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  57.69 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  59.54 
 
 		 203 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  57.4 
 
 		 201 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  42.8 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  47.25 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  52.02 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  44.04 
 
 		 208 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  46.45 
 
 		 207 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  46.37 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  37.71 
 
 		 205 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  37.44 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  37.95 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  37.95 
 
 		 208 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  42.31 
 
 		 209 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  36.47 
 
 		 206 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  36.47 
 
 		 206 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  40 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  40 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  41.95 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  40.13 
 
 		 208 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  37.5 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  38.31 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.07 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  37.06 
 
 		 216 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  29.59 
 
 		 209 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  32.95 
 
 		 218 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  37.28 
 
 		 213 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  36.47 
 
 		 228 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  33.14 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.29 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  38.51 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  35.68 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  34.13 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  28.09 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  36.53 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  33.51 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  37.41 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  31.14 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  31.25 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  30.95 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  31.28 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  33.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  31.74 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  36.05 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.36 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  24.04 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  24.04 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  27.6 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  24.04 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  26.02 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.36 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  28.78 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  26.34 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  29.61 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  25.96 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  25.58 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  27.91 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  27.51 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.44 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.84 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>