161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3833 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  100 
 
 		 213 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  71.36 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  63.46 
 
 		 208 aa  241  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  59.31 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  67.63 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  55.24 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  52.8 
 
 		 222 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  52.83 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  55.5 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  63.73 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  52.28 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  55.12 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  58.74 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  54.4 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  56.77 
 
 		 219 aa  178  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  44.67 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  45.69 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  45.69 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  49 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  43.08 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  47.76 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  43.98 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  47.62 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  52.91 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  38.81 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  47.2 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  42.71 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  38.78 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  36.45 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  39.59 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  37.07 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  36.36 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  34.85 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.88 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.88 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  38.46 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  40.62 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.29 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  36.81 
 
 		 298 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  38.86 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 298 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.68 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  36.17 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  35.94 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  34.59 
 
 		 298 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  34.59 
 
 		 298 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  37.28 
 
 		 301 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.12 
 
 		 298 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  36.69 
 
 		 299 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.05 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  35.63 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  40.45 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  39.43 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  36.36 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  36.36 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  32.28 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  39.43 
 
 		 272 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  36.41 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  36.7 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  34.98 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  35.53 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  29.47 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  34.52 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.31 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  33.16 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  35.83 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  35.29 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  29.9 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  35.52 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  35.52 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  38.55 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  36.07 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  34.2 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  34.02 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  35.71 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.76 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  32 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  30.53 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  33.85 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  28.12 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  35.08 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  34.55 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  29.21 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  26.8 
 
 		 331 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  25.51 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  24.41 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>