228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0409 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  100 
 
 
204 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  62.5 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  55 
 
 
211 aa  234  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  60 
 
 
209 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  58.55 
 
 
205 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  63.64 
 
 
201 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  58.67 
 
 
208 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  60.8 
 
 
298 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.69 
 
 
298 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.69 
 
 
298 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  59.77 
 
 
301 aa  206  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  58.82 
 
 
299 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  58.19 
 
 
301 aa  205  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  57.84 
 
 
298 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  57.84 
 
 
298 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  58.66 
 
 
297 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.3 
 
 
298 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.99 
 
 
258 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  57.95 
 
 
298 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.76 
 
 
298 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  59.76 
 
 
298 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.76 
 
 
298 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  50.49 
 
 
232 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  61.71 
 
 
272 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  60 
 
 
272 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  58.29 
 
 
303 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  53.61 
 
 
207 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  57.3 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  56.12 
 
 
200 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  55.56 
 
 
303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  51.02 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  45.81 
 
 
276 aa  158  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
266 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  44.75 
 
 
272 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  41.21 
 
 
225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  41.5 
 
 
208 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  41.5 
 
 
208 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  41.4 
 
 
206 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  41.4 
 
 
206 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  41.8 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  46.52 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  45.36 
 
 
216 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  42.05 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  34.67 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  45.45 
 
 
211 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  45.45 
 
 
211 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  49.11 
 
 
269 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  36.22 
 
 
218 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  42.71 
 
 
213 aa  121  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  40.45 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  39.67 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  38.14 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.14 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  37.69 
 
 
208 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.98 
 
 
210 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  36.73 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  35.38 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  36.55 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  36.6 
 
 
213 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.14 
 
 
205 aa  106  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  35.75 
 
 
283 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  38.66 
 
 
228 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  38.42 
 
 
216 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.92 
 
 
214 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.6 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  36.16 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  36.41 
 
 
245 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  40.32 
 
 
207 aa  92  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  36.32 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  37.77 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.49 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  31.67 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.57 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  32 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.95 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.21 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  30.18 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  27.45 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  25.91 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.61 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  32.68 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  27.75 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.29 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  26.34 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  29.82 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  24.87 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 
342 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  29.63 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>