244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1534 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  73.91 
 
 		 208 aa  314  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  73.91 
 
 		 208 aa  314  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 266 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  47.74 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  45.15 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  43.75 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  43.48 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  45.77 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  42.57 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  41.15 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  43.84 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  40.3 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  44.67 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  41.21 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  39.22 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  38.95 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  41.62 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  41.03 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  38.22 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  35.58 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  42.42 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  37.23 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  41.9 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  35.58 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  46.15 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  43.81 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  44.33 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  42.05 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  43.28 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  39.64 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  37.44 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  42.08 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  36.41 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  36.9 
 
 		 298 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  35.98 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.42 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.42 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  37.99 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  33 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.71 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  37.98 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  40 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  35.2 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 298 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  39.36 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  33.85 
 
 		 298 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  33.85 
 
 		 298 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.39 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  34.66 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  36.13 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  36.13 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  32.51 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.54 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  40.57 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  36.92 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  38.66 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  40.66 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  33.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  34.07 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  34.33 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  31.52 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  33.85 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  38.54 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  36.32 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  28.57 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  34.76 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  35.42 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  30.39 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  32.9 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  34.92 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  36.41 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.11 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  33.33 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  29.41 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  29.41 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  35.09 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  30.48 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  35.4 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  32.98 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  29.38 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.61 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  29.76 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.49 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.32 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>