106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1006 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  59.7 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  54.46 
 
 		 210 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  52.63 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  56.31 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  51.67 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  53.5 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  54 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  59.31 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  56.04 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  55.29 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  59.2 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  51.49 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  48.76 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  45.79 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  42.58 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  43.84 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  41.86 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  38.97 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  40.1 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  35.86 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  46.27 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  41.58 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  41.58 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  36.92 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  43.65 
 
 		 283 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  41.09 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  39.51 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  39.9 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  33.33 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  33.65 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  40.95 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  38.66 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  38.14 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  42.86 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.52 
 
 		 298 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.52 
 
 		 298 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  41.84 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  32.68 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  40.57 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  41.14 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  34.85 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.29 
 
 		 298 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  36.93 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  36.76 
 
 		 301 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  35.29 
 
 		 298 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  37.06 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  35.76 
 
 		 298 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  35.76 
 
 		 298 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.76 
 
 		 298 aa  98.2  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 298 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.76 
 
 		 298 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  34.05 
 
 		 299 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  36.92 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  39.44 
 
 		 303 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  34.27 
 
 		 297 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  31.47 
 
 		 276 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  33.82 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  34.74 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  32.98 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  32 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  33.33 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  31.89 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  29.41 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  34.87 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  34.87 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  33.67 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.25 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  35.14 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  31.75 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  34.05 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  35.26 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  29.61 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  29.61 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  33.16 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.5 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  30.46 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  32.62 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  28.8 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  32.73 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  31.41 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 		 316 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  26.64 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  28.49 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  29.03 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  31.44 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  27.72 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  26 
 
 		 309 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  22.75 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  24.61 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>