133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4511 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  100 
 
 
199 aa  387  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  69.27 
 
 
198 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  67.37 
 
 
199 aa  248  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  68.98 
 
 
199 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  70.16 
 
 
198 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  67.55 
 
 
194 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  62.77 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  60.43 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  67.27 
 
 
201 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  65.31 
 
 
196 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  60.73 
 
 
207 aa  203  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  63.22 
 
 
206 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  58.64 
 
 
212 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  63.22 
 
 
205 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  62.07 
 
 
205 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  49.73 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  61.8 
 
 
108 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  34.76 
 
 
283 aa  87.8  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  34.87 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  32.99 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  36.22 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.65 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  36.16 
 
 
222 aa  82  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  34.22 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  34.22 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  34.76 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  30.73 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.93 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  30.77 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  37.23 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  32.97 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  30.26 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.33 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.33 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  29.31 
 
 
297 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 
266 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  34.32 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  26.47 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  32.66 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.23 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  29.17 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.74 
 
 
298 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  31.63 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.45 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  28.22 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  26.84 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  33.53 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  31.95 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  31.21 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  31.1 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  28.31 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  31.36 
 
 
301 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  33.12 
 
 
298 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.72 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.36 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  31.25 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  30.53 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  29.9 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.89 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  29.57 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  29.57 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  31.87 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  31.87 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  31.45 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  28.8 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  29.17 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  35.15 
 
 
272 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  26.4 
 
 
211 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  34.55 
 
 
272 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  30.22 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  26.71 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  29.82 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
309 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  29.83 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  30.46 
 
 
303 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  33.54 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  31.72 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  31.55 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 
311 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  28.57 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.36 
 
 
314 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  29.22 
 
 
269 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
311 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  32.5 
 
 
228 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  31.95 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  29.59 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
333 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  25.6 
 
 
299 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  27.22 
 
 
307 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
333 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  32.61 
 
 
334 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.46 
 
 
312 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>