129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3386 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  87.56 
 
 		 207 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  77.89 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  58.38 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  47.21 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  40.93 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  47.8 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  47.8 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  45.45 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  38.3 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  37.17 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  44.39 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  40 
 
 		 301 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  43.48 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  42.13 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  42.49 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  42.49 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.97 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  40 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  41.75 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.41 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  39.49 
 
 		 276 aa  128  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  38.46 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  43.43 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  43.37 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.38 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  40.51 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  45.45 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  41.67 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  40.3 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  40.51 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.09 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.09 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  44.13 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  37.31 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  41.99 
 
 		 272 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.26 
 
 		 298 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  46.45 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  42.86 
 
 		 272 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  42.13 
 
 		 269 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  37.11 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.86 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  33.68 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  24.63 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  33 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  29.41 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  30.65 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  31.91 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  35.52 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  28.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  27.09 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  32.29 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  29.57 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  28.11 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  29.32 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  29.67 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  33.33 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  34.02 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  27.64 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  32.43 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.58 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  29.75 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  26.88 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  30.05 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  30.14 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  28.65 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  24.73 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  30 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  31.82 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  31.25 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  31.79 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  29.83 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  25 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  29.9 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  24.4 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  28.65 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  26.77 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  21.6 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  27.75 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  29.63 
 
 		 245 aa  51.6  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  27.05 
 
 		 378 aa  49.3  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  29.46 
 
 		 320 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 305 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 332 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  26.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>