220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3624 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  57.29 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  55.33 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  47.78 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  38.97 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  41.4 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  38.66 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  38.81 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  41.71 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  42.29 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  37.31 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  40.7 
 
 		 298 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  45.6 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  44.79 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  47.62 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.34 
 
 		 298 aa  127  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.34 
 
 		 298 aa  127  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  35.64 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  39.88 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  41.3 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.8 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.1 
 
 		 298 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  47.8 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  47.8 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  37.99 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  37.99 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  35.59 
 
 		 301 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.55 
 
 		 298 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  39.11 
 
 		 298 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  36.47 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  34.78 
 
 		 276 aa  121  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.29 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  39.04 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  43.43 
 
 		 272 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  42.86 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  36.55 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  33.5 
 
 		 266 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  37.5 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  37.5 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  36.13 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  41.4 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  41.34 
 
 		 272 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  33.15 
 
 		 272 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  37.37 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  33.16 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  37.1 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  38.04 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  34.95 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  35.52 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  34.02 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  32.99 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.8 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  36.36 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  36.22 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  37.04 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  31.72 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  31.18 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  33.68 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  30.57 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  36.46 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  26.6 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  30.39 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  32.62 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  32 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  29.61 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  34.43 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  34.05 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  32.98 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  29.57 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  31.69 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  23.32 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  31.72 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  30.65 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.97 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  31.47 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  33.09 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  27.89 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  26.29 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  32.45 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>