220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1956 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  53.67 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  53.06 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  46.63 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  48.45 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  53.68 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  48.19 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  46.04 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 266 aa  174  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  44.33 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.76 
 
 		 298 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.76 
 
 		 298 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  48.13 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  47.78 
 
 		 298 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  46.45 
 
 		 301 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  43.58 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  39.22 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.06 
 
 		 298 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  39.22 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  39.22 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.2 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.95 
 
 		 258 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  46.33 
 
 		 301 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  41.88 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  47.43 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.85 
 
 		 298 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  48.02 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  48.02 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  45.11 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  46.86 
 
 		 272 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  44.33 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.33 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  46.33 
 
 		 298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  45.14 
 
 		 272 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  45.36 
 
 		 303 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  40.1 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  42.93 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  37.11 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  36.55 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.55 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  40.66 
 
 		 272 aa  134  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  33.17 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  35.64 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  33.33 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  33.17 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  39.04 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  39.04 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  40.96 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  39.67 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.98 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  36.13 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  30.5 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  37.07 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.5 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.27 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  35.52 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  37.99 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  35.71 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  37.04 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  36.07 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  34.12 
 
 		 236 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  37.64 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  34.57 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  39.53 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  35.57 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  37.31 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  35.75 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  37.31 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  37.95 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  40.62 
 
 		 269 aa  98.2  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  31.14 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  32.93 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  33.14 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  33.85 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  30.69 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  30.99 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  30.69 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  32.3 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  30.35 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.35 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  29.85 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.73 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  25.81 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  30.3 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  30.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  28.64 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  25.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  31.52 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>