110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2582 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  100 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  73.66 
 
 
207 aa  241  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  75.49 
 
 
211 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  75.49 
 
 
211 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  57.07 
 
 
208 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  45.77 
 
 
205 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  42.19 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  41.88 
 
 
276 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  44.56 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  44.56 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  37.7 
 
 
211 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  37.43 
 
 
209 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  41.62 
 
 
201 aa  141  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  42.44 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  49.03 
 
 
298 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  49.03 
 
 
298 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  40.62 
 
 
297 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  45.11 
 
 
299 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.39 
 
 
298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.17 
 
 
298 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.17 
 
 
298 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  47.74 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  46.45 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  42.31 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  43.1 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  42.58 
 
 
301 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.16 
 
 
298 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  45.81 
 
 
298 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  44 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  35.71 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  39.46 
 
 
203 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  40.76 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  37.63 
 
 
232 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  42.94 
 
 
298 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  47.7 
 
 
272 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  41.67 
 
 
272 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  47.13 
 
 
272 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  40 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  38.34 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  36.76 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  37.24 
 
 
200 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  25.5 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  39.27 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  29.95 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  29.95 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  29.15 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
266 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  29.06 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  32.71 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  30.65 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  29.8 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  27.5 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.31 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  29.47 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  29.02 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  29.51 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  29.21 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  29.83 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  32.02 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  32.22 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  28 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  32.02 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  30.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  29.65 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  22.62 
 
 
324 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  30.89 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  29.75 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.55 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  25.94 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  30.05 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.57 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  26.15 
 
 
306 aa  54.7  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  26.7 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.51 
 
 
314 aa  53.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  25.38 
 
 
312 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  30.21 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  31.15 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  26.94 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  28.93 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  25.14 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  27.92 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  29.47 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  22.35 
 
 
298 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  27.12 
 
 
303 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  27.57 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 
317 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
306 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  27.13 
 
 
198 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 
311 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  24.86 
 
 
305 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  22.78 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>