166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1655 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  70.15 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  66.01 
 
 		 222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  65.2 
 
 		 213 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  62 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  68.78 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  57.69 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  58.82 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  67.16 
 
 		 213 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  54.46 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  61.11 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  55.24 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  56.22 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  51.63 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  61.58 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  50.97 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  50.98 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  44.12 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  44.02 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  44.02 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  44.34 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  43.98 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  36.95 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  41.88 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  43.46 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  44.85 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  44.02 
 
 		 245 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  34.17 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  36.08 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  36.98 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  33.66 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  32.84 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  37.63 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  32.46 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  30.41 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.84 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.84 
 
 		 298 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  36.07 
 
 		 301 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  35.12 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  36.31 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  36.31 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  36.07 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  36.62 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  34.95 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.71 
 
 		 298 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  37.14 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.42 
 
 		 298 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  37.5 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  32.83 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  38.86 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  31.12 
 
 		 297 aa  91.7  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  37.71 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  36.14 
 
 		 303 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  40.4 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  37.11 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  34.76 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  34.3 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  36.5 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  29.1 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  34.66 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  40.24 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  38.22 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  36.93 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  31 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  30.98 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  35 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  32.64 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  25.26 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  33.16 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  31.16 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  36.98 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  33.86 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  36.98 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  29 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  30.27 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  27.83 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  30.26 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  28.24 
 
 		 312 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  29.03 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  27.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  27.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  31.22 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  28.11 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  28.11 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  21.95 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>