114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0765 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  100 
 
 		 198 aa  383  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  70.26 
 
 		 198 aa  267  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  70.16 
 
 		 199 aa  261  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  73.12 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  69.63 
 
 		 199 aa  252  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  67.19 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  61.93 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  60.5 
 
 		 203 aa  221  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  61.54 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  64.24 
 
 		 201 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  62.37 
 
 		 196 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  59.66 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  54.6 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  60.23 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  59.09 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  48.37 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  66.67 
 
 		 108 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.37 
 
 		 245 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.13 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  36.31 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  34.9 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  28.71 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  31.75 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  31.52 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  32.45 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  30 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  31.96 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  26.19 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  32.5 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  32.5 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  27.69 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  27.17 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  31.5 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  32.3 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  26.18 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  31.75 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  31.96 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  26.34 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  29.12 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  29.83 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  29.52 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  29.95 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  25 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.31 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.04 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  35.63 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  29.63 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  31.05 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  30.95 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.71 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  28.31 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  32.74 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  27.71 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  30.65 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.72 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  34.97 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  26.51 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  26.51 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  29.35 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  26.9 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.95 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.95 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0554  hypothetical protein  31.98 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  27.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.11 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  32.05 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  25.43 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  29.31 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  29.17 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  29.19 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  28.72 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  27.95 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  29.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  29.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  30.17 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  31.98 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  26.35 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  27.01 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3423  hypothetical protein  30.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  28.65 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 307 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  20.67 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  20.67 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  21.89 
 
 		 316 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  25.99 
 
 		 312 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>