109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1827 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  100 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  88.42 
 
 		 199 aa  320  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  75 
 
 		 198 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  74.74 
 
 		 194 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  67.37 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  67.37 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  66.67 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  73.12 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  71.66 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  65.28 
 
 		 207 aa  217  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  67.46 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  65.36 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  60.89 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  59.78 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  55.43 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  46.67 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  74.44 
 
 		 108 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  38.98 
 
 		 283 aa  88.2  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  33.51 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  39.46 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  37.04 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  34.69 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  42.02 
 
 		 245 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  32.8 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  36.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  35.42 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  32.64 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35.75 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  29.67 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  37.91 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  31.98 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  31.98 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  29.67 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  30.85 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  35.35 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  34.05 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  32 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  35.26 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  34.21 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.38 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  28.49 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  32.34 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  32.65 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  28.65 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.34 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.34 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  28.09 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  32.45 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  30.57 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  31.18 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.19 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.83 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  26.55 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  35.15 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  26.2 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  32.45 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  24.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  27.44 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  30.65 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  30.65 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  26.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  29.61 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  25.44 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  25.44 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  25.77 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  25.77 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  25.29 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  25.73 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  29.8 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  23.21 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  35.94 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  26.83 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  32.74 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  33.14 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  31.4 
 
 		 303 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  32.09 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  32.3 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  30.85 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  30.59 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  32.16 
 
 		 272 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  24.28 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  28.65 
 
 		 309 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  32.52 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 333 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 333 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  28.05 
 
 		 294 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  28.34 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  25.73 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3423  hypothetical protein  29.34 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>