25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7128 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3423  hypothetical protein  46.32 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0554  hypothetical protein  41.71 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  31.75 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  31.31 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  29.31 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  33.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  30.54 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.72 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  28.65 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  33.1 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  30.85 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  31.58 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  24.77 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  29.21 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  31.76 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  29.21 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  27.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  27.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  28.72 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  29.89 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  28.19 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  29.34 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  26.58 
 
 		 211 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  28.36 
 
 		 283 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>