102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0679 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0679  transporter  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  74.74 
 
 		 199 aa  288  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  78.12 
 
 		 198 aa  287  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  76.72 
 
 		 199 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  67.2 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  67.55 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  67.03 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  71.2 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  67.19 
 
 		 198 aa  227  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  65.45 
 
 		 207 aa  218  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  63.91 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  61.11 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  56.11 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  58.33 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  57.22 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  47.83 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  75.56 
 
 		 108 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  38.92 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  39.04 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  37.11 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  38.55 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  34.04 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  34.43 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  37.71 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  35.9 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  38.46 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  31.25 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  33.33 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  33.51 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  34.74 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.9 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  31.58 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  35.53 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  35.53 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  32.98 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  31.48 
 
 		 298 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  30.99 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  31.14 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  30.67 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  30.67 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.11 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.11 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  32.62 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  37.13 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  30.3 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.29 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  31.02 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.79 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  36.02 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  29.01 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  25.5 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  33.16 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  34.39 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  29.82 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.33 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  28.81 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  32.12 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  29.45 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  35.92 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  31.09 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  31.09 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  27.12 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  34.22 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  34.59 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  26.02 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  28.83 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  31.76 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  28.07 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  29.94 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  31.71 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  30.93 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  30.56 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3423  hypothetical protein  31.09 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  25.15 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  32.14 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  35.44 
 
 		 272 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  34.57 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  30.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  29.94 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  30.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0554  hypothetical protein  32.8 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  32.56 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  31.76 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  25.15 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  28.66 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  28.27 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 309 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 		 306 aa  41.2  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>