109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1788 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  80 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  71.35 
 
 		 198 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  67.37 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  67.55 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  65.57 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  67.2 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  60.43 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  60.5 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  60.66 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  60.71 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  60.94 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  61.2 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  60.11 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  51.15 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  44.89 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  60.22 
 
 		 108 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  40.33 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  33.87 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  34.3 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  35.47 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  31.82 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  31.82 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  35.38 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  35.03 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  33.33 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  30.57 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  30 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  31.11 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  30.98 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  31.22 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  30.11 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  29.35 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  31.14 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  29.89 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.21 
 
 		 298 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.21 
 
 		 298 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.43 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  25.93 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  31.71 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  27.6 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  25.43 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  31.58 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  26.71 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  33.16 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  27.6 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  30.54 
 
 		 298 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  27.88 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  36.7 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.88 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.75 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  30.86 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  28.29 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  30.36 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  28.12 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  28.12 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  28.48 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  27.68 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  28.67 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  30.09 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  29.3 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  26.22 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  32.77 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  31.47 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  31.47 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  27.15 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  30.68 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  23.96 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  31.93 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  31.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  28.18 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7128  hypothetical protein  30.54 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  30.52 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  30.32 
 
 		 272 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  26.11 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  34.54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  31.68 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  25.25 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  34.57 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.75 
 
 		 393 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  29.81 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  31.84 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  27.6 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0554  hypothetical protein  32.61 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  29.94 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 		 316 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  22.5 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  23.49 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  22.5 
 
 		 316 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  26.9 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>