More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0859 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 
303 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  55.29 
 
 
298 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.05 
 
 
298 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.05 
 
 
298 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  54.08 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.74 
 
 
298 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  53.4 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  53.4 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.06 
 
 
298 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  53.17 
 
 
297 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  55.1 
 
 
298 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.53 
 
 
298 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  51.54 
 
 
299 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.37 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  61.11 
 
 
272 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  59.93 
 
 
272 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  47.75 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  47.4 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.54 
 
 
258 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  54.68 
 
 
272 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  51.67 
 
 
303 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  41.97 
 
 
276 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  41.13 
 
 
272 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  57.38 
 
 
204 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  55.68 
 
 
201 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  51.63 
 
 
203 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  51.67 
 
 
205 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  48.89 
 
 
211 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  45.66 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  50.55 
 
 
208 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  49.72 
 
 
209 aa  168  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  47.51 
 
 
232 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  47.57 
 
 
207 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  41.85 
 
 
206 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  41.85 
 
 
206 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  41.34 
 
 
266 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  42.78 
 
 
208 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  42.78 
 
 
208 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  41.57 
 
 
225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  49.17 
 
 
200 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  40.91 
 
 
209 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  43.68 
 
 
208 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  33.69 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  41.21 
 
 
211 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  41.21 
 
 
211 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  41.08 
 
 
208 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  38.55 
 
 
208 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  37.08 
 
 
205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  40.43 
 
 
208 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  37.1 
 
 
213 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  38.42 
 
 
216 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  41.21 
 
 
207 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  36.52 
 
 
211 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  42.86 
 
 
228 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  37.14 
 
 
210 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  39.44 
 
 
216 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  28.25 
 
 
209 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  34.59 
 
 
212 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  39.15 
 
 
213 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  34.86 
 
 
222 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.86 
 
 
213 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  35.39 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  39.9 
 
 
214 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  34.25 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  38.98 
 
 
213 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.1 
 
 
245 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.96 
 
 
205 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  35.23 
 
 
216 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  34.34 
 
 
198 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  31.28 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  36.57 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  38.54 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.33 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  32.09 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  30.11 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  34.71 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  34.84 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  33.12 
 
 
199 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  28.18 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  31.87 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  31.82 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.22 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  29.34 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  29.09 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.44 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  32.28 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  38.13 
 
 
783 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  27.62 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>