30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4008 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4008  Co/Zn/Cd efflux system component-like protein  100 
 
 		 108 aa  207  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.695421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  77.27 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  74.44 
 
 		 199 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  77.01 
 
 		 198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  75.56 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  60.22 
 
 		 203 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  61.8 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3754  cation efflux protein  66.67 
 
 		 205 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  64.04 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3445  cation efflux protein  62.92 
 
 		 205 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  62.96 
 
 		 201 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  57.3 
 
 		 201 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  61.05 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0765  putative transporter  68.24 
 
 		 198 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6350  putative cation efflux transporter  77.05 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.107602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  55.29 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06110  hypothetical protein  46.75 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  35.44 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  39.68 
 
 		 245 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  35.06 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  41.94 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  43.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  38.24 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  38.67 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  39.73 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  31.25 
 
 		 204 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.25 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.38 
 
 		 298 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.38 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.38 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>