234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2025 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  72.55 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  64.56 
 
 		 209 aa  271  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  55 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  57.22 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  56.41 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  54.79 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  57.69 
 
 		 301 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  56.67 
 
 		 301 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  53.59 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.89 
 
 		 298 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  50.81 
 
 		 298 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  50.81 
 
 		 298 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  51.38 
 
 		 298 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 298 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.35 
 
 		 258 aa  194  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  53.07 
 
 		 297 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  50.77 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  55.43 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.81 
 
 		 298 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.67 
 
 		 298 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.67 
 
 		 298 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  47.94 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  53.71 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  54.29 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  42.21 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  48.13 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  48.45 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  48.63 
 
 		 272 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  50.29 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  47.34 
 
 		 272 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  43.5 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  35.58 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  37.84 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  37.31 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  37.31 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  43.39 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  36.17 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  36.17 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  35.83 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  38.74 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  33.65 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  37.17 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  35.47 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  37.17 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  31.34 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  32.23 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  33.85 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  32.98 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  33.68 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  30.41 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  34.85 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  30.94 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  30.57 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  31.19 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  33.5 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  30.1 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  33.84 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  31.58 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  33.65 
 
 		 245 aa  98.2  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.18 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  31.31 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  27.36 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  28.92 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  33.82 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  28.11 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  29.06 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  29.13 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  27.72 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  32.35 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  28.1 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  28.1 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  28.1 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 327 aa  62  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  26.4 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  24.59 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  26.61 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  26.22 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.31 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  24.5 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  24.5 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  25.54 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  22.92 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  26.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  24.1 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  28.48 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  28.14 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  27.09 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>