29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0893 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  79.55 
 
 		 298 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  69.32 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  61.36 
 
 		 298 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.35 
 
 		 298 aa  67  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.35 
 
 		 298 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.35 
 
 		 298 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  48.15 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  70.37 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  67.74 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 739 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  32.26 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  30.69 
 
 		 301 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  56.67 
 
 		 272 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  51.35 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  44.23 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 726 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  37.1 
 
 		 297 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>