99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2931 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  52.02 
 
 		 735 aa  669    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.27 
 
 		 725 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.41 
 
 		 731 aa  729    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 730 aa  1424    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 		 732 aa  627  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  31.91 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.27 
 
 		 707 aa  221  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  31.18 
 
 		 710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  30.68 
 
 		 637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  31.48 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  30.43 
 
 		 634 aa  211  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  29.43 
 
 		 611 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  28.85 
 
 		 722 aa  204  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  31.69 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  27.66 
 
 		 612 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  30.72 
 
 		 648 aa  195  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  30.61 
 
 		 612 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  30.79 
 
 		 761 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  30.32 
 
 		 761 aa  188  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  29.4 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  30.39 
 
 		 761 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  27.17 
 
 		 612 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  29.32 
 
 		 758 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.05 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.05 
 
 		 721 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.05 
 
 		 721 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.9 
 
 		 501 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  41.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.18 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.83 
 
 		 706 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.8 
 
 		 514 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  28.88 
 
 		 491 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.02 
 
 		 703 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.78 
 
 		 503 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.09 
 
 		 439 aa  51.6  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.3 
 
 		 696 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  43.94 
 
 		 598 aa  51.6  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.3 
 
 		 696 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0870  RNA binding S1 domain protein  41.56 
 
 		 756 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.55 
 
 		 722 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 		 702 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 		 702 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  32.74 
 
 		 754 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.31 
 
 		 696 aa  47.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.68 
 
 		 436 aa  47.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 		 706 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.31 
 
 		 697 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3152  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.37 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.782441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  32.46 
 
 		 756 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1854  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.3 
 
 		 716 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  45.16 
 
 		 767 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.31 
 
 		 697 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  37.1 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 705 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  41.33 
 
 		 772 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.43 
 
 		 703 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 717 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3573  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.43 
 
 		 445 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168579  hitchhiker  0.00774159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.29 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.31 
 
 		 699 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1557  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.16 
 
 		 445 aa  45.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  39.02 
 
 		 775 aa  45.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.16 
 
 		 769 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2302  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.16 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0779138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 734 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  37.5 
 
 		 734 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1044  30S ribosomal protein S1  36.14 
 
 		 392 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 702 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.5 
 
 		 406 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 587 aa  45.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 705 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 705 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 705 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 711 aa  45.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.71 
 
 		 704 aa  44.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.3 
 
 		 742 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.554464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.71 
 
 		 700 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.71 
 
 		 700 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0615  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.71 
 
 		 711 aa  44.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 784 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  48.78 
 
 		 558 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.81 
 
 		 735 aa  44.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  31.96 
 
 		 302 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.28 
 
 		 712 aa  44.3  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.32 
 
 		 459 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  39.02 
 
 		 529 aa  44.3  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  37.8 
 
 		 795 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.57 
 
 		 471 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>