151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2720 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.01 
 
 		 731 aa  731    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  53.87 
 
 		 725 aa  729    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  74.03 
 
 		 732 aa  1014    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 735 aa  1437    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  51.75 
 
 		 730 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  38.8 
 
 		 637 aa  289  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  33.78 
 
 		 707 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  34.53 
 
 		 710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  36.81 
 
 		 634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  32.17 
 
 		 722 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  34.66 
 
 		 636 aa  262  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  34.18 
 
 		 641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  30.6 
 
 		 612 aa  250  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  33.27 
 
 		 611 aa  251  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  31.36 
 
 		 761 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  30.78 
 
 		 761 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  34 
 
 		 648 aa  243  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  30.59 
 
 		 761 aa  242  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  32.95 
 
 		 611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  31.95 
 
 		 612 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  29.19 
 
 		 761 aa  231  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  31.16 
 
 		 758 aa  227  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  32.38 
 
 		 612 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.76 
 
 		 721 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.76 
 
 		 749 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  42.68 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  44.3 
 
 		 766 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.76 
 
 		 721 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 705 aa  51.2  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 706 aa  50.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 711 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  40.28 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0330  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.82 
 
 		 1538 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 706 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  50.82 
 
 		 718 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  31.75 
 
 		 788 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  39.24 
 
 		 779 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  39.24 
 
 		 770 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  39.24 
 
 		 779 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.66 
 
 		 722 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 803 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1854  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.94 
 
 		 716 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7595  RNA binding S1 domain protein  47.62 
 
 		 797 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  40.85 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.24 
 
 		 514 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 711 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  30.88 
 
 		 765 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.04 
 
 		 503 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.45 
 
 		 712 aa  47.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  38.89 
 
 		 720 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  35 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6672  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.03 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.24 
 
 		 501 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0021  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.44 
 
 		 303 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000787373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  44.68 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.21 
 
 		 702 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.21 
 
 		 702 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 701 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 672 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  44.07 
 
 		 598 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2844  Tex-like protein protein-like protein  42.11 
 
 		 815 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  46.77 
 
 		 775 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.85 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  43.75 
 
 		 719 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34820  transcriptional accessory protein  46.03 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 781 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  44.44 
 
 		 772 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 481 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  43.75 
 
 		 719 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  33.05 
 
 		 787 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  44.44 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.89 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 787 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 481 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.31 
 
 		 722 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  44.44 
 
 		 772 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 772 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  41.54 
 
 		 782 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0895  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.16 
 
 		 861 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.85 
 
 		 696 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.96 
 
 		 774 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>