23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0735 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  59.47 
 
 		 612 aa  764    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  50.58 
 
 		 707 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  53.3 
 
 		 722 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1259    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  64.69 
 
 		 611 aa  794    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  65.02 
 
 		 611 aa  809    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  51.33 
 
 		 710 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  65.18 
 
 		 612 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  44.88 
 
 		 636 aa  525  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  44.96 
 
 		 648 aa  524  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  45.38 
 
 		 634 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  44.08 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  41.91 
 
 		 641 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  40.91 
 
 		 758 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  40.31 
 
 		 761 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  38.59 
 
 		 761 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  38.44 
 
 		 761 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  38.47 
 
 		 761 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.6 
 
 		 735 aa  240  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.56 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.52 
 
 		 731 aa  211  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.12 
 
 		 732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.85 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>