86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3472 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  59.1 
 
 		 722 aa  885    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  55.04 
 
 		 611 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  51.33 
 
 		 612 aa  651    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  64.6 
 
 		 707 aa  975    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  55.09 
 
 		 611 aa  660    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  53.4 
 
 		 612 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1453    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  54.71 
 
 		 612 aa  681    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  41.57 
 
 		 761 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  41.41 
 
 		 758 aa  587  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  41.04 
 
 		 761 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  40.9 
 
 		 761 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  40.42 
 
 		 761 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  43.75 
 
 		 641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  41.92 
 
 		 648 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  42.95 
 
 		 636 aa  495  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  42.43 
 
 		 634 aa  485  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  42.72 
 
 		 637 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.35 
 
 		 735 aa  266  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.99 
 
 		 725 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.67 
 
 		 732 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.33 
 
 		 731 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.51 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  34.12 
 
 		 384 aa  54.3  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.66 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  38.1 
 
 		 376 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.25 
 
 		 574 aa  51.6  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  34.88 
 
 		 380 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  27.98 
 
 		 469 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  34.88 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  37.84 
 
 		 355 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 373 aa  49.7  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  34.88 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  32.94 
 
 		 375 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  33.72 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  32.56 
 
 		 376 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  37.33 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.72 
 
 		 377 aa  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  33.72 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  32.93 
 
 		 376 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  27.85 
 
 		 736 aa  47.8  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  32.39 
 
 		 373 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  35.21 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  36.99 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  32.94 
 
 		 404 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 		 376 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  37.84 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  31.76 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  31.08 
 
 		 375 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  33.77 
 
 		 388 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  34.67 
 
 		 381 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  31.34 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  30.95 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  32.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  25.37 
 
 		 566 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  30.59 
 
 		 387 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 373 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.36 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  34.67 
 
 		 381 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.59 
 
 		 566 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 		 373 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  32.14 
 
 		 377 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.15 
 
 		 989 aa  45.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  34.12 
 
 		 387 aa  45.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  31.17 
 
 		 378 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  33.78 
 
 		 368 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.2 
 
 		 779 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.2 
 
 		 779 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.2 
 
 		 779 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  26.2 
 
 		 779 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  26.2 
 
 		 779 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  29.21 
 
 		 381 aa  44.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  31.08 
 
 		 374 aa  44.3  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.2 
 
 		 779 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  29.89 
 
 		 375 aa  44.3  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  31.4 
 
 		 374 aa  44.3  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.62 
 
 		 702 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 381 aa  43.9  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.2 
 
 		 779 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 566 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 757 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 757 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3179  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.21 
 
 		 365 aa  43.9  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000698212 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  34.72 
 
 		 373 aa  43.9  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  31.03 
 
 		 368 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>