More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0198 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
404 aa  817    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  69.51 
 
 
387 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  63.95 
 
 
387 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  62.27 
 
 
380 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  61.17 
 
 
396 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  62.83 
 
 
383 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  59.48 
 
 
374 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  56.41 
 
 
391 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  54.87 
 
 
390 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  52.05 
 
 
398 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  52.88 
 
 
387 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  53 
 
 
400 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  51.03 
 
 
394 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  53.77 
 
 
404 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  53.83 
 
 
392 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  53.83 
 
 
392 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  53.83 
 
 
392 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  52.19 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.73 
 
 
393 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
389 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
396 aa  328  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  51.64 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  49.72 
 
 
361 aa  327  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  48.28 
 
 
373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50.25 
 
 
396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  48.89 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  46.22 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  46.22 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
376 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
376 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
376 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
376 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
376 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
376 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
376 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
375 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45.3 
 
 
379 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  43.65 
 
 
376 aa  298  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.38 
 
 
378 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.38 
 
 
378 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.01 
 
 
377 aa  296  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
374 aa  295  8e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  45.57 
 
 
378 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  44.29 
 
 
375 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  44.38 
 
 
377 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 
372 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  44.9 
 
 
382 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
379 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
379 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
379 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  42.51 
 
 
375 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  43.82 
 
 
377 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  43.73 
 
 
389 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  44.11 
 
 
373 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  45.16 
 
 
380 aa  285  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 
376 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  42.29 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 
380 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
386 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 
374 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
368 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
377 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
370 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  39.89 
 
 
379 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
376 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  39.47 
 
 
376 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
377 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  42.54 
 
 
368 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.29 
 
 
378 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  43.85 
 
 
373 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.16 
 
 
378 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  39.2 
 
 
376 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
375 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
379 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.85 
 
 
381 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
378 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
375 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
385 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  40.77 
 
 
381 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  40.97 
 
 
383 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
374 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
388 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>