More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
387 aa  774    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  68.02 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  58.31 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  60.47 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  58.78 
 
 
391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  56.84 
 
 
390 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  56.44 
 
 
394 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  58.36 
 
 
393 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  59.95 
 
 
395 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  59.02 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  56.85 
 
 
400 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  59.02 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  59.02 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  55.96 
 
 
383 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
396 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  53.66 
 
 
404 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
404 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  54.95 
 
 
380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  54.08 
 
 
389 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  52.11 
 
 
374 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  51.06 
 
 
361 aa  346  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  52.09 
 
 
387 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.25 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  53.07 
 
 
396 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  49.05 
 
 
373 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  44.15 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  46.03 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  46.03 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  60.56 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
376 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  44.63 
 
 
372 aa  298  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.9 
 
 
377 aa  296  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  45.81 
 
 
379 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  45.81 
 
 
379 aa  295  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  45.81 
 
 
379 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
378 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 
378 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  49.62 
 
 
396 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
376 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
376 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.72 
 
 
376 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  43.99 
 
 
375 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  43.56 
 
 
380 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  43.47 
 
 
376 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  43.13 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
377 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
374 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  43.41 
 
 
379 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  45.03 
 
 
375 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
376 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
378 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
375 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.21 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  43.49 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
378 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
378 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
378 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
378 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  42.58 
 
 
378 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.78 
 
 
381 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
375 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.66 
 
 
377 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
373 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  44.03 
 
 
372 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  42.29 
 
 
374 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.58 
 
 
378 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  43.01 
 
 
378 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  45.73 
 
 
374 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
378 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
377 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
377 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
373 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 
389 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  43.09 
 
 
377 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
379 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
388 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
376 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  43.32 
 
 
377 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
376 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  43.73 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>