More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0488 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
400 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  70.75 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  66.5 
 
 
394 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  67.58 
 
 
393 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  67.41 
 
 
392 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  67.41 
 
 
392 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  67.41 
 
 
392 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  66.42 
 
 
395 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  58.38 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 
390 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  55.7 
 
 
398 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  52.7 
 
 
391 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  52.26 
 
 
387 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
389 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  53.25 
 
 
404 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  48.99 
 
 
380 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  49.24 
 
 
383 aa  342  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  51.05 
 
 
374 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  48.62 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  50.51 
 
 
404 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  48.17 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.88 
 
 
393 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  46.46 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  48.49 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  49.26 
 
 
396 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  49.61 
 
 
396 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
379 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
379 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
379 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  42.12 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  41.01 
 
 
374 aa  289  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.31 
 
 
376 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.31 
 
 
376 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
377 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  43.68 
 
 
374 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
376 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  42.52 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  59.18 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  43.39 
 
 
376 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.86 
 
 
377 aa  282  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
379 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
379 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
379 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
379 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
379 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
375 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
380 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
369 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  42.52 
 
 
375 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
382 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  41.37 
 
 
379 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  41.37 
 
 
379 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
376 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  43.8 
 
 
379 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  44.04 
 
 
380 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
378 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  43.01 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  41.45 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  42.78 
 
 
378 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.16 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
376 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
376 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
376 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  42.22 
 
 
374 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  41.1 
 
 
375 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.68 
 
 
377 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
376 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  41.33 
 
 
381 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  41.95 
 
 
374 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  41.01 
 
 
378 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  41.95 
 
 
371 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
376 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
376 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
376 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  42.48 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  40.52 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.42 
 
 
377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  41.05 
 
 
393 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  41.19 
 
 
381 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
377 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  42.02 
 
 
377 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>