More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6947 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
398 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  68.53 
 
 
387 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  56.39 
 
 
400 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  59.84 
 
 
391 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  58.31 
 
 
387 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  58.01 
 
 
390 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  56.42 
 
 
394 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  59.79 
 
 
392 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  59.79 
 
 
392 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  59.79 
 
 
392 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  57.39 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  54.34 
 
 
396 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  57.03 
 
 
393 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  57.22 
 
 
395 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  52.82 
 
 
404 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  58.4 
 
 
404 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
383 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 
380 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  54.09 
 
 
389 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  53.77 
 
 
387 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  52.07 
 
 
374 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
361 aa  355  5e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.63 
 
 
393 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  49.63 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  45.24 
 
 
373 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  48.98 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
378 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  42.45 
 
 
376 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
377 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  55.24 
 
 
400 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 
378 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  41.34 
 
 
389 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.89 
 
 
376 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
374 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
376 aa  285  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  42.38 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  42.38 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  42.41 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  41.53 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  41.53 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  41.53 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  43.38 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  42.12 
 
 
376 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  42.45 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.86 
 
 
376 aa  282  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.9 
 
 
378 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  41.26 
 
 
378 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 
377 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  40.89 
 
 
380 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  43.12 
 
 
377 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.41 
 
 
378 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.41 
 
 
378 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.41 
 
 
378 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.67 
 
 
378 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.67 
 
 
378 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
376 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
377 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  40.41 
 
 
378 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
373 aa  279  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  40.53 
 
 
376 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  40.83 
 
 
379 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  40.94 
 
 
372 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
372 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  40.84 
 
 
381 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  39.48 
 
 
381 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  39.84 
 
 
365 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  41.93 
 
 
376 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.93 
 
 
379 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  40.36 
 
 
378 aa  275  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  40.44 
 
 
379 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.24 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  41.15 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.31 
 
 
375 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  38.02 
 
 
377 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  39.69 
 
 
374 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>